Указ о создании академии подписал в 1688 году прусский курфюрст Фридрих I. Организация учреждения шла под кураторством выдающегося немецкого философа и математика Готфрида Лейбница, который стал первым президентом новой научной организации.
Лейбниц предложил назвать её «Научное общество курфюрста бранденбургского». Король отказался финансировать проекты академии, но предоставил ей эксклюзивное право на печать календарей в Бранденбурге – небольшую, но важную финансовую подушку для стартапа.
В 1701 году Фридрих I возглавил Пруссию, и академию переименовали в Королевское прусское научное общество. При этом учёным открыли доступ к собственной обсерватории, анатомическому театру и ботаническому саду, что существенно расширило возможности для исследований. Устав общества, принятый в 1719 году, оставался в силе до 1830 года.
С 1744 года, уже при Фридрихе II, учреждение получило новое название – Королевская академия наук. Появилось более стабильное финансирование, была построена современная лаборатория, а в советский совет академии вошли ведущие учёные того времени. К XIX веку Прусская академия уже считалась одним из самых авторитетных научных центров Европы.
XX век принес тяжёлые испытания. При нацистском режиме академию подвергли расовой чистке: многие учёные были отстранены от должностей или вынуждены были покинуть страну. После окончания войны на её базе была создана Германская академия наук, а в 1971 году она получила название Академия наук ГДР.
С объединением Германии в 1990 году институт получил современное название – Берлин‑Бранденбургская академия наук (нем. Berlin‑Brandenburgische Akademie der Wissenschaften). Сегодня она продолжает традицию многовековой научной деятельности, объединяя исследователей из разных стран и дисциплин в одном из самых динамичных научных центров Европы.
